在进行聚类之前，首先要确定类间距的计算方法，通常类与类之间的距离通过样本之间的距离来确定。常用类间距的计算方法包括最短距离法、最长距离法、重心法、类平均法等。在实际应用中，使用不同的类间距定义方法，可能将得到不同的聚类结果。

表示不同的类，表示类和间的距离，表示样本与之间的距离。

①最短距离法。将类与类之间的距离定义为两类中相距最近的样本之间的距离：

(1)

②最长距离法。将类与类之间的距离定义为两类中相距最远的样本之间的距离：

(2)

③重心距离法。将类与类之间的距离定义为两类重心间的距离：

(3)

式中和分别为类和的样本均值。

④类平均法。两类样本中，所有观测值两两观测间距离的平均作为类间距离：

(4)

式中和分别为类和中的样本数。