基础地质航空物探调查是随着航空物探测量技术的进步而逐步形成的。1994年颁布的中国国家标准《航空磁测技术规范》正式提出基础地质航空物探调查的概念。中国航空物探在基础地质研究中得到了广泛应用，因此中国航空物探的发展历史也是中国基础地质航空物探调查的发展历史。

基础地质航空物探调查的基本内容主要包括设计、航空物探系统测试与校准、野外数据采集、数据处理及室内解释等，提供磁场、电磁场、重力场、放射性场等基础数据和地壳结构、基底构造、区域构造、断裂构造、岩浆岩、变质岩、沉积岩等基础地质信息，在条件具备情况下进行地质填图或辅助地质填图，如识别或追踪地质体。①许多火成岩和变质岩都具有磁性，根据磁场的特征可以区分并圈定它们的分布范围，包括非磁性盖层下的隐伏部分；②许多火成岩、变质岩和沉积岩具有独特的放射性特征，根据放射性场的特征可以区分并圈定它们的分布范围；③许多火成岩、变质岩和沉积岩具有独特的磁性和密度特征，根据磁场和重力场的组合特征，可开展三维地质填图。

与环境航空物探调查、矿产资源航空物探调查等其他航空物探调查不同，基础地质航空物探调查的目的主要是要解决基础地质问题，辅助地质填图和成矿地质背景研究，推动地学科学进步和为国民经济建设服务。同时，基础地质航空物探调查不是一种独立的航空物探调查，一般结合环境航空物探调查、矿产资源航空物探调查、油气资源航空物探调查等共同开展。