冰芯微生物是一项气候环境指标。冰芯以其分辨率高、记录时间长、信息量大和保真度高等特点，成为全球变化研究的重要载体。通过对冰芯样品中诸多气候环境指标的分析，如反映气温的氢氧同位素、反映人类活动的铅元素等重金属，即可重建过去气候环境的变化。在南极、北极、青藏高原、南美钻取得到的不同深度的冰芯中，都分离出大量种类丰富的细菌，分子生物学的方法进一步揭示了冰芯细菌的高度多样性。冰芯细菌的数量和物种组成与冰芯的深度和年代没有显著相关，但与气候环境和大气环流密切相关，不同深度细菌的数量和群落结构反映了细菌对不同历史阶段气候环境的响应。