藏语意为黑岩山湖，因其周围的山石颜色发黑而得名。位于青海省玉树藏族自治州治多县索加乡境内北部无人区，北纬35°30′22″～35°37′18″，东经91°47′12″～92°05′48″。湖面海拔高度4758米，湖长27.69千米，最大宽15.9千米，平均宽8.55千米，湖岸线长91千米，面积256.4平方千米。地质构造处于早第三纪陆相断陷盆地与晚印支褶皱带接合部，属于库赛湖-玛沁断裂带的断陷西端，在昆仑山南麓大雪峰南侧宽谷内，滨湖北部为晚三叠系地层构成的湖中北山，山体紧临湖边，湖盆内为第四系全新统冲积-洪积砂砾层，其中西部卓乃河冲积-洪积扇上分布着一些湖泊退缩后形成的面积仅为0.01～0.05平方千米的残留小湖，湖底多为泥质粉砂沉积。湖水来源主要依靠西北部五雪峰冰川南缘的卓乃河及其支流水系，河长65千米，在下游渗漏砂砾之中以潜流形式入湖，汇水面积1520平方千米。第四纪时期，因气候变化，湖面较高时湖水流经东端库赛河注入库赛湖；湖面较低时湖泊退缩，为半闭流类型湖泊。湖水密度1.006，pH值8.67，矿化度12.82克/升，湖水含有钠、钾、钙、镁等离子，属硫酸钠亚型微咸水湖。湖区属青南高寒草原半干旱气候，气候严寒，风力强劲，8级以上大风日数每年在200天以上，年平均气温-4.0～-2.0℃，最低气温达-41℃，年降水量100～150毫米。湖中有水草生长，湖滨牧草生长良好，野生动物资源丰富，是藏羚羊主要的产仔地（见图），每年7～8月湖滨南岸有几万头母藏羚羊聚集，景象壮观；9月藏羚羊则返回越冬地与公羊合群。

卓乃湖边的雌性藏羚羊