位于青藏公路、青藏铁路昆仑山口东侧约20千米处，北纬35°39′，东经94°14′，海拔6178米。玉珠峰是早更新世末至中更新世初发生的昆仑—黄河强烈构造运动的产物，本次运动使昆仑山山口盆地急剧抬升，湖泊急剧萎缩，构造带发生强烈断陷成昆南断裂带，在玉珠峰北麓形成了西大滩、东大滩等盆谷。距今15万年左右，本区再次发生强烈的构造运动，玉珠峰北坡的水系强烈深切，因河流袭夺和溯源侵蚀形成西大滩、东大滩水系等。属典型的大陆性气候，气候寒冷、干旱，主峰受西南季风末梢的影响，夏季地形降水丰富。年平均气温-5℃，极端最低气温可达-30℃，平均年降水量200毫米左右，南坡随着海拔升高降水增加，海拔5000米以上的地区平均年降水量可达600毫米，降水主要集中在7～8月。山顶常年被冰雪覆盖，山体南缓北陡：①南坡相对平缓，山麓地带为草滩坪坝，与高原面相接，海拔4800米左右，平坦宽阔，植物生长较好，野生动物丰富，山间河流密集，山前有高原湖泊发育，冰川末端海拔约5100米。②北坡地形相对复杂，有冰裂缝、冰塔林、冰陡坡、刃形山脊等，冰川末端延伸至海拔4400米，冰川面积6.75平方千米，长5.7千米。植被以高寒草原为主，植物种类相对稀少，蕨类植物以陆生类型为主，缺乏附生类型和水生类型。

玉珠峰及青藏铁路上的火车