河南汝宁府确山县人。生而颖异，日记千言，目视数行，号称神童。12岁补邑庠生，后为国子生。嘉靖二十二年（1543）河南乡试第十五名，二十九年殿试三甲，赐同进士出身，授中书舍人，官有余闲，观览群书。后升工科给事中，以慷慨时事，数上危言，谪魏县丞，量移淮安府推官，历官宁波、苏州二郡同知，迁南京户部郎中。出为淮安兵备副使，淮扬多盗，耀文悉擒治之，民为其立德政碑，寻升陕西太仆寺卿，因倦游不乐边塞，未到任，请告归。抵家闭门谢客，日以著述为事，卒年82岁。

陈耀文平生喜编书著书，文渊阁《四库全书》经部收录其《经典稽疑》2卷，现存民国庐江刘氏远碧楼刻本；子部类书类收录其《天中记》60卷，现存明隆庆三年（1569）刻本、万历刻本3种和清道光林则徐刻本、光绪四年（1878）听雨山房刻本等；子部杂家类收录其《正阳》4卷，现存明隆庆三年刻本、清刻本和民国庐江刘氏远碧楼刻本；集部词曲类收录其辑《花草稡编》12卷附《乐府指迷》1卷，现存万历十一年（1583）刻本和民国刊本数种。另有万历刻本《学林就正》4卷、《学圃萱蘓》6卷。又曾主纂《确山县志》2卷，有嘉靖三十六年（1557）刻本存世。