MR水成像技术的原理主要是利用水的长T2权重效应，即长TR（多大于3000毫秒）加特长TE（多大于150毫秒）。人体所有组织中，水样成分（如脑脊液、淋巴液、胆汁、胃肠液、尿液等）的T2值远远大于其他实质性脏器，在采用序列时重点突出组织的T2特性。水样结构由于T2值很长保持较大的横向磁化矢量，而其他组织的横向磁化矢量几乎完全衰减，所采集的图像信号主要来自水样结构，因此采用长TR、特长TE的重T2加权快速自旋回波序列，从而使体内静态或缓慢流动的液体呈现高信号，而实质性器官和快速流动的液体如动脉血呈低信号。

早期的水成像技术多采用梯度回波类序列，而临床上常采用快速自旋回波序列FSE或单次激发FSE T2WI序列。利用二维或三维技术采集的水成像原始图像需要进行后处理重建，常用的后处理技术包括：最大强度投影（MIP）、容积重建（VR）和仿真内窥镜（VE）等。 

水成像技术具有无须对比剂、安全无创、适应证广、成功率高、可多方位观察等优点，得到了较为广泛的应用，主要包括：MR胆胰管成像、MR尿路成像、MR脊髓成像、MR内耳水成像、MRI涎腺管成像、MR输卵管成像、MR泪道成像、MR脑室系统成像等。