管理和技术的有机结合是复合污染控制的关键对策。需对复合污染生态效应和作用机理进行深入研究，在此基础上将科学管理和高效技术两个方面有机结合，从而实现复合污染控制的系统化、科学化。在强调优化产业结构、加强点源污染达标排放控制、重视环境立法以外，还应针对控制对象、科学管理、实用技术等重要问题开展深入工作。

①进一步提高污染排放控制指标的科学化水平。中国环境质量及污染排放的评价和控制指标基本以常规指标为主，须从物理、化学、生物及其毒性等方面，制定出真正科学和有效的控制与评价标准，并根据新的研究结果和发现不断进行修正，保证污染控制的有效性和科学性。同时，应根据中国复合污染的特点和调查研究结果，制定出优先污染物清单。②严格控制化学品的使用。应重视在工业、农业等过程中减少有毒有害化学品的使用和污染物排放，严格限制污染化学品的生产，有效控制或阻断化学品进入环境的途径。在背景调查和科学研究的基础上，提出控制名单和使用限量，制定系列的实施办法，在生产-销售-使用全过程进行系统控制。③实施清洁生产与末端治理相结合的治污技术和方法。采取清洁生产工艺，将以最低的消耗、最大的生产效率和最少的污染物产生获得最好的产品，清洁生产是污染控制的有效途径。但是，清洁生产并不等于零排放。需要将清洁生产与高效的末端治理技术进行有机结合，发展和推广系统集成的技术体系，形成从生产工艺优化到达标处理的完善的技术系统。