贝贾语共有5个元音和21个辅音，并有简单的声调变化。贝贾语与其他邻近地区的语言，如库施特语族东支的阿法尔语和索马里语、中库施特语支的阿戈语（Agaw）存在约20%的共同词汇，且从阿拉伯语中吸收了大量借词。

语法上，贝贾语名词区分数（单数、复数）、性（阴性、阳性）、格（主格、间接格、所有格）和有定性等语法范畴；动词分为刚性动词和柔性动词并区分时态（过去、现在、将来）、体（完成、非完成）、情态（动机、弱祈使、愿望、可能）和有定性等语法范畴；名词短语中，形容词位于名词中心语之后，且与名词在数、性、格和有定性上保持一致；基本语序为主-宾-动型。

贝贾语文字主要使用拉丁字母书写，同时也有使用阿拉伯字母的书写体系。