海阳省永赖县中庵乡（今属海防市永保县理学社）人。阮秉谦于1535年在莫朝科考中连中三元，成为状元。之后历任莫朝的吏部左侍郎、东阁大学士、吏部尚书等职，受封程国公。1542年，由于不满莫朝统治中的腐败，愤而辞官归隐。归乡后兴办学校，教授儒学。阮秉谦生活的时期一直处于越南各政权纷争之际，黎、莫、广南阮氏各路势力都争相拉拢阮秉谦，莫主、郑主、阮主都曾征求过他的意见。阮秉谦建议郑王挟黎皇号令天下，对阮主则建议在未开发的越南南部地区建立根据地，而对莫主则建议据高平之地可延数世福。郑检、阮潢、莫茂洽都听从了他的意见，黎、郑与广南阮氏政治和军事互相抗衡200余年，莫氏偏安于高平又延继近百年基业。阮秉谦由此拥有洞查明辨、预知未来的智者名声，被当代学者称作“越南的诺斯特拉达姆士”。此外，阮秉谦在文学创作上也取得很高造诣。他著有众多汉诗和喃字诗，其中有不少流传至今，著有《白云先生诗集》《白云庵诗文集》《白云庵程国公诗集》《白云庵程国公录记》《程先生国语》《谶记祕传》《程国公谶记》，诗文在各类选本中经常出现，如《全越诗录》《名诗合选》等。在民间信仰中，阮秉谦同孙中山、V.雨果，被后世的高台教并称为高台教的“三圣”。