隶属于美国私立研究型大学哈佛大学文理学院（Harvard Faculty of Arts and Sciences），成立于20世纪30年代，位于马萨诸塞州剑桥市牛津街，招收本科生、硕士研究生和博士研究生。现任行政主任是D.S.温格尔（David S.Unger），系主任是A.哈林顿（Anne Harrington）。科学史系现有A.M.布朗德特（Allan M.Brandt）、A.哈林顿（Anne Harrington）、J.布朗尼（Janet Browne）、J.莫敦奇（John Murdoch）、O.金格里奇（Owen Gingerich）、L.R.格里汉姆（Loren R.Graham）、G.霍尔顿（Gerald Holton）、P.L.盖里逊（Peter L.Galison）、S.夏平（Steven Shapin）、G.S.拉文革（Gabriela Soto Laveaga）、R.利莫夫（Rebecca Lemov）、E.门德尔松（Everett Mendelsohn）和N.欧睿斯克斯（Naomi Oreskes）等多位学者。

科学史系的研究对象不仅包括自然科学和医学，如古典物理学、生物学、化学、数学和医学的历史；还包括社会科学，如经济学、政治学、心理学、史学、性别和种族研究；以及人文学科，如文学、艺术和哲学史。科学史系将科学社会学融入科学史研究方法之中，并与肯尼迪学院的科学技术与社会（Science，Technology and Society）项目建立密切联系。科学史系的目标是全面探索知识的历史、地方和全球的各种交叉联系；同时，使用越来越广泛的方法，从档案近距离阅读到物质文化、人种学和参与者观察等等；面向越来越多的受众，从学院学者到国际对话的参与者，讨论全球卫生、气候变化、核材料处置以及政府的监管政策。

全系有教职员工39人、攻读硕士和博士学位研究生48人、博士后和访问学者14人。该系的教授著述丰富，产生广泛影响的学术著作有《能源保护原理的历史之根》（The Historical Roots of the Principle of the Conservation of Energy），《麦克斯韦与普朗克科学思想中热力学的构造》（The Conception of Thermodynamics in the Scientific Thought of Maxwell and Planck），《差异的本质：美国从杰夫逊到基因组学的人种科学》（The Nature of Difference:Sciences of Race in the United States from Jefferson to Genomics），《科学相册：古代和中世纪》（Album of Science:Antiquity and the Middle Ages），《心灵安顿者：精神病学关于精神病生物学的纷乱探索》（Mind Fixers:Psychiatry's Troubled Search for the Biology of Mental Illness），《商人的疑问：一小撮科学家怎样遮蔽了从烟草吸食到全球警示的主题真相？》（Merchants of Doubt:How a Handful of Scientists Obscured the Truth on Issues from Tobacco Smoke to Global Warming），《西方文明的崩溃：一个来自未来的观点》（The Collapse of Western Civilization:A View from the Future）。科学史系拥有世界上最大且藏品最丰富的历史科学仪器展览馆，藏品是哈佛大学从1962年就开始收集的各种科学仪器。该馆于1948年成立，并于1987年划归于科学史系。科学史系所享有的图书资源有美国最大的哈佛大学怀德纳图书馆（Widener Library），同时建有科学史系图书馆，主办《综合体》（Synthesis）期刊。