理论上空间编码频域扫描获取的信号信噪比较高，但由于探测器的动态范围与光敏二极管相比较小，会造成信噪比的损失。在使用波长为1300纳米工作的时候，由于在这个波长区域动态范围的问题并不严重，因此信噪比的损失尚可接受。这种方法的缺点是信噪比会出现严重下降的情况，信噪比的下降和零延迟的距离成正比。由于探测器的波长受限，信噪比依赖于深度以辛格函数的形式衰减。由于一个像素是探测到的光学频谱区域的一段，而不是单一的频率，对其进行傅里叶变换就会产生辛格函数。另外，频谱探测器中的色散元件一般也无法将光线依其频率线性投射在探测器上，而通常是按照频率的倒数投射，这种非线性效应会进一步降低信号的质量。随着电荷耦合元件具有更多像素的新一代元件或光敏二极管阵列，信噪比的下降并不是一个严重的问题。此外，合成阵列外差检测可以作为解决这一问题的另一个手段，而不需要使用高色散的元件。