在汛期入库水流含沙量高时，水库采用低水位运行，将大量泥沙排出水库，减少水库泥沙淤积；在非汛期入库水流含沙量低时，水库采用蓄水运用，以提高水库的综合效益。采用这样的运用方式，不仅可以减缓水库泥沙淤积进程，而且可以长期保持一定的有效库容，避免水库被完全淤满的风险。

水库蓄清排浑运用是中国水利工作者从黄河三门峡水库运用实践中总结出来的。1960年9月三门峡水库蓄水后，发生了严重淤积。为减缓水库泥沙淤积，三门峡水利枢纽进行了改建，同时采用水库蓄清排浑运用，使泥沙淤积得到控制，实现年内冲淤平衡。

采用水库蓄清排浑运用时，需注意：①水库枢纽要有足够的泄流能力，使水库在洪水期能够保持低水位运行。②对于高坝大库，在水库运行初期，由于库区过流断面面积很大，水流输沙能力对水位变化不敏感，蓄清排浑效果有限，在研究水库总体效益与蓄清排浑之间的关系之后，决定在何种程度上采用蓄清排浑运用。③蓄清排浑运用一般要服从防洪调度。④在总体上采用蓄清排浑运用方式下，可同时进行异重流排沙。

中国多数水库均采用蓄清排浑运用方式，如小浪底水库、三峡水库、溪洛渡水库等。蓄清排浑运用方式可使水库的大部分有效库容得以长期保留，延长水库使用寿命。