中医药历史悠久，医界同人很早就曾经结社启学，通过定期集会的形式切磋医理，勖勉医德医风。早在16世纪，明代新安医学家徐春甫就在北京发起组织了“一体堂宅仁医会”，会员为8个省集于京师的46位医师。学会除集会研讨医术外，还编撰《古今医统大全》。在徐春甫所著《医学入门捷径六书》中，有《一体堂宅仁医会录》一卷，其中详细记载了办会的宗旨、会款、会规及参会成员等内容。《会录》记载日期为明代隆庆二年（1568），可知该会创办时间当在1568年之前，堪称最早的中医药学术团体。

清末民初之际，西方医学大规模传入，为振兴中医药，全国或地方性的中医药学术团体相继建立。较有影响的有1904年和1905年，周雪樵等人在上海创建的医学研究会、中国医学会；1906年李平等在上海创建的上海医务总会；1907年中国留学生在日本创立的中国医药学会；1908年成立的医学世界社；1910年丁福保在上海创立的中西医学研究会；1910年袁桂生在扬州创立的扬州中西医研究会；1911年在湖州成立的湖州医学会；1919年在山西太原成立的中医改进研究会；1921年颜伯卿、葛吉卿等人在上海成立的神州医学会，在山东济南成立的医学研究会，丁甘仁、夏应堂在上海创立的上海中医学会；1929年在南京成立的南京中医公会；1936年徐恺、谢利恒在上海创立的中医科学研究社等。民国时期，这些学术团体还曾采取过全国统一行动以维护中医权益，向国民政府请愿抗争。例如，1929年3月，全国15个省132个中医药团体代表在上海集会，议决成立全国医药总会，派代表去南京请愿，迫使当局撤销“废止旧医以扫除医事之障碍案”。抗日战争期间，各学会活动停止。

1949年，中华人民共和国建立以后，中华中医药学会、中国中西医结合学会、中国针灸学会、世界针灸学会联合会、世界中医药学会联合会等全国性、国际性学术组织先后成立，还有各省级的学术组织和专业委员会。他们创办期刊、组织学术会议、推广普及中医药相关知识，为中医药的发展做出了积极贡献。