多用于水下暗礁和浅滩等复杂海区地貌的探测。测深设备通常采用单波束测深仪。加密探测是依测图比例尺在图上以0.25～0.5厘米间隔布设加密线进行探测。为使图面清晰，必要时可放大比例尺探测。加密测深线的方向应视具体情况确定，一般采用布设纵横加密线方式探测。水下暗礁和浅滩（也称特殊深度）按水深变化率可分成弱、中、强三级。变化率在10%～20%的为弱级，变化率在20%～30%的为中级，30%以上为强级。

对特殊深度的探测，应在已测资料的基础上，首先进行搜索探测（即以特殊深度为中心布设3-4条相互交叉或平行的测深线），以大体弄清其延伸范围及判断更浅水深的走向。如发现有更浅水深，应继续探测，以确实探明其最浅水深及位置。

对特殊深度探测的详尽程度，一般不应机械地按其等级之强弱而应根据其所处海区地貌情况及其重要性来确定。如对航行有影响的地段或处于平坦地段的特殊深度，即使是弱级特殊深度也应详尽探测；对于航行无甚影响或地貌复杂海区，一般对中、强级特殊深度才予以详细探测。

中级以上且深度浅于20米的孤立礁石，必须进行加密或放大比例尺探测。凡由旧海图转绘的暗礁，当新测的最浅水深与旧图注记的水深之差大于旧图注记水深值的2倍测深精度时，应进一步探测或扫测。对已有可靠资料或经调查已知其概位的水下障碍物，采用扫海测量方法探测其最浅深度及位置，并适当加密以探测其范围。群礁地区的探测，应测出其最外围礁石和主要礁峰的位置、高程（高度），并适当描绘其他礁石的相对位置和绘出群礁的危险界。为了判别障碍物的性质，在加密探测的同时应探测底质。传统的单波束测深仪加密探测正在被侧扫声呐扫海测量和多波束扫海测量（全覆盖测量）所替代。