目录疫病包括陆生动物和水生动物及蜜蜂等的疫病。这些疫病的特征是具有高度传染性和播散性、高发病率和较高致死率，具有重要的经济和政治意义，其中许多是人兽共患病。

所有目录疫病都是WTO成员国在进行动物及其产品国际贸易时必须执行的检疫项目，出口国在出口动物及其产品前必须予以排除，否则进口国一旦检出并在争议中获得WOAH参考实验室复检认证，出口国将承担相应的法律和经济赔偿责任。目录疫病的种类由WOAH陆生动物法典委员会根据成员国每年动物疫病的流行情况进行修订、增减。2018版《国际动物卫生法典》（第27版）列通报疫病共计117种，其中陆生动物疫病88种，水生动物疫病29种，前者包括多种动物共患和人兽共患病23种，牛病14种，羊病11种，猪病6种，禽病13种，马病11种，兔病2种，蜂病6种，其他2种；后者包括鱼病10种，贝类疫病7种，虾蟹类疾病9种，两栖类动物疾病3种。中国农业部于1999年根据疫病流行烈度及政治、经济意义，将动物疫病分为一、二、三类：对人与动物危害严重，需要采取紧急、严厉的强制预防、控制、扑灭等措施的为一类疫病；可能造成重大经济损失，需要采取严格控制、扑灭等措施，防止扩散的为二类疫病；常见多发、可能造成重大经济损失，需要控制和净化的为三类疫病。一类动物疫病列有17种，如禽流感、猪瘟、非洲猪瘟等；二类动物疫病77种（包括蜂病2种、鱼和甲壳动物疫病17种），如狂犬病、牛结核病等；三类动物疫病63种（包括鱼贝虾等水生两栖动物疫病17种），如动物大肠杆菌病、肝片吸虫病及犬瘟热等。