从比较医学角度研究环境医学的重要试验和理论方法。环境指围绕动物的生活生存空间以及各种介质因素，可根据是否受到人类活动影响而分为原生环境和次生环境，前者是自然形成的，后者则受到人类活动的显著影响，这种影响一方面会更加适合动物生存繁衍，如动物棚舍等，另一方面则会造成环境污染和生态破坏，对动物产生明显危害或威胁。

传统观念认为，这些环境因素包括动物放牧或生存生活栖息地的地球化学/物理因素（如地质性微量元素缺乏或含量过高、放射性等）、草原草场的有毒植物、媒介生物、寄生虫、细菌、病毒等；后来，人们逐渐认识到，生态环境的破坏和恶化、动物生产管理中动物福利措施不当或不足，对动物健康与疾病发生和发展均有着不可忽视的影响。一般而言，环境因素对动物健康的影响都具有剂量效应/反应关系，这也是制定卫生标准的理论基础。

环境兽医学是发展中的学科，其研究内容主要包括：①地球化学性环境因素对动物健康的效应特征及机理。如地方性微量元素缺乏或含量过高导致动物微量元素缺乏症或中毒，具有地区局限性，同时都伴有人类相应疾病的发生和流行，又称地方病，如地方性硒缺乏、地方性氟中毒等。②动物的有毒植物中毒。有毒植物的分布和（过度）生长往往与地区性土壤条件（如酸碱度、土质等）及降雨量和季节有密切关系，过度放牧引起的草场退化或沙漠化也会导致某些有毒植物的滋生和扩散。③动物的环境污染物中毒。环境污染物包括工业三废排放物及其光化学等作用下产生的衍生物、人类生活排放物、动物生产排放物等，可从空气、水体、土壤及饲料植物等途径对动物健康产生影响。工业污染物中毒如工业性氟中毒是环境兽医学和兽医内科学的经典问题。值得注意的是动物生产过程排放物是已被逐步认识到的公共卫生威胁因素，包括微量元素添加剂对土壤的污染、粪便尿液微生物群所荷载的抗生素抗药基因组等。④人类对自然资源过度利用和开发导致的生态环境破坏和恶化，引起自然疫源性人兽共患病复燃、扩散。如对森林过度采伐，致使野生动物和媒介生物生存环境丧失，使它们从野生环境（森林型）向家居环境迁移，将森林型循环的病原体引向人居环境，导致疫病流行和扩散。⑤动物生存生长环境福利缺乏对动物健康的影响，如肉鸡过密饲养引发相关的腹水症等。

环境兽医学的研究方法主要有环境流行病学和环境毒理学方法，都需要有生物统计学或卫生统计学理论和技术的支撑。另外，基因分析技术也已广泛用于环境抗药组（即环境微生物包括动物排放物中微生物群所携带的所有抗药基因）的检测分析和公共卫生安全评价。