化学风化作用是指微生物通过改变含磷矿物的化学结构，直接或间接地改变母质层的化学组成的过程。矿化作用是指微生物可以通过自身酶的作用，将有机结合磷转化成无机磷的过程。由于最初的有机磷无法透过细胞膜被生物体吸收，转化后相当于为这些生物体提供了养料。溶解作用是指将难溶性磷矿物转化为可溶性磷的过程。微生物通过这一过程促进非生物储存库（如岩石、土壤、河流、湖泊、海洋等）中的磷元素转化，不仅可以满足以磷为养分的微生物的生长，还可以为其他生物提供易利用的磷元素。磷固定是指微生物把溶解态的磷转化成固定态，从而减少生物可利用磷的过程。这一过程包括暂时固定和形成矿物两种方式。在活着的微生物体内进行的有关磷固定反应称为暂时固定，而矿物形成则意味着产生可以长期稳定存在的磷矿。