海岸带微生物由多种类群组成，包括细菌、真菌、古菌、微型浮游藻类等，与远洋微生物相比，其数量和多样性在短时间内变化较大。在海水表层，光线充足，陆地交汇区域丰富的营养盐可以促使微生物很好地生存繁殖。海岸带最显著的特点是海洋潮汐的规律性涨落，海滩时而被淹没，时而被暴露出来，生境类型多样化。海岸带是波浪、潮汐、海流等作用形成的滨水地带，环境条件多变，表层营养盐供应充足，为不同的微生物提供了良好的生境，使得海岸带微生物群落具有很高的生物多样性和生产力。人类活动的加剧，导致海岸带生源要素（例如碳、氮、磷、硅等）的输入增加，该区域已经成为重要的元素循环场所，如生物驱动的氮循环、碳循环等。