成立于1962年，隶属于国际微生物学会联合会（International Union of Microbiological Societies，IUMS），国际食品微生物与卫生委员会（International Committee on Food Microbiology and Hygiene）中的独立专家组织。通过IUMS、ICMSF与国际生物科学联盟（International Union of Biological Societies ，IUBS）和世界卫生组织（World Health Organization，WHO）建立了紧密的联系。

主要目标包括：为微生物标准及其制定与应用原则提供科学依据；为各国间因微生物标准和检验方法不同带来的问题提供科学的解决方案。国际食品微生物标准委员会的委员来自不同国家的政府机构、大学和食品行业，具有丰富的食品微生物学研究经验，兼具风险评估、生态/生理学研究、公共卫生、农业、食品技术、食品安全管理、质量控制和教育背景。

国际食品微生物标准委员会是国际食品法典委员会（CAC）的观察员组织，在参与国际食品卫生法典委员会（Codex Committee on Food Hygiene, CCFH）会议等国际食品安全事务中，不断创建、更新食品微生物学及食品安全管理新概念，如以统计学模型为基础，在食品微生物检验及微生物标准体系中倡导运用微生物分级采样方案（n、c、m、M）；强调HACCP控制体系与良好卫生操作规范（GHP）的联合应用；提出食品安全目标（Food Safety Objective，FSO）等，得到国际食品法典委员会的采纳和全球社会的广泛认同。成立以来，已编撰、修订出版了食品微生物丛书第一至第八卷，引领全球在预防微生物性食源性疾病、保障食品安全、促进国际贸易的事务中发挥了不可替代的作用。

2004年，国际食品微生物标准委员会首次批准中国微生物学专家刘秀梅研究员为委员会委员，并成立ICMSF中国及东北亚分会。2010年起中华人民共和国国家标准将国际食品微生物标准委员会的微生物分级采样方案纳入食品安全国家标准体系，包括GB 4789.1—2016《食品安全国家标准 食品微生物学检验 总则》和GB 29921—2013《食品安全国家标准 食品中致病菌限量》。