包括库坝区渗漏问题、库岸稳定问题、水库浸没问题、水库淤积问题、水库诱发地震5类。①库坝区渗漏问题。是指库水沿岩石孔隙、裂隙、断层、溶洞等向库盆以外或通过坝基向下游渗漏的现象。库坝区渗漏会影响效益，导致坝基渗透变形，威胁大坝安全。防渗措施包括灌浆帷幕、截水墙、铺盖、隔离与导排、堵洞等。②库岸稳定问题。包括塌岸、滑坡、岩崩等。③水库浸没问题。指水库蓄水后水位抬升，引起水库周围地下水壅高的现象。水库浸没可导致农田沼泽化或盐碱化、建筑物地基强度降低、矿坑渗水等。对于城镇工矿区域可采取防渗堵截或疏干排水等工程措施治理，农田可采取工程与农业相结合的治理方案。④水库淤积问题。河流入库后，由于水流搬运能力下降导致所携带的泥沙沉淀堆积于库底。水库淤积会降低水库效益；水深变浅，妨碍航运和渔业，影响水电站运转；影响上下游防洪、灌溉及生态平衡。可采取水力排沙、水力冲刷和机械清淤等方法改善。⑤水库诱发地震。是指因水库蓄水导致坝区、水库库盆或近岸范围内发生的地震。水库诱发地震的规模小，但会对库区周围及大坝造成影响，因此在修建大型水库前，必须开展水库诱发地震危险性评价。