菌类可分为细菌门、黏菌门和真菌门，其中与药用关系密切的是细菌门和真菌门。可供药用的真菌已达到100多种，其分布以子囊菌纲和担子菌纲为最多。子囊菌纲的主要特征是在特殊的子囊中形成子囊孢子，如冬虫夏草、蝉花、竹黄等药用菌。担子菌的主要特征是不形成子囊，而依靠担子形成担孢子来繁殖。药用的部分主要是子实体。菌类有丰富的有利于人体健康的营养成分，这些成分提升了食用菌的使用价值，包括蛋白质、糖类、纤维、脂肪、维生素、矿元素、核酸等。

菌类丰富的营养成分和生物活性成分使得其有较多的保健功效，主要有以下几项：①诱导人体产生干扰素，增强抗病毒功能；②增强免疫细胞功能，提高人体免疫力；③抑制肿瘤细胞增殖，提高机体抗肿瘤功能；④降低胆固醇在体内的积累，防止心血管疾病的发生；⑤清除体内自由基，增强机体抗衰老功能。