与活化作用有关的水文地球化学作用包括溶解、解吸附、氧化-还原、络合等过程。与活化作用相反的过程称为阻滞作用，是指地下水中溶解组分在某些水文地球化学作用下进入含水介质或浓度降低的过程，与阻滞作用有关的水文地球化学作用包括沉淀、吸附、氧化-还原、降解等。

地下水系统中溶解组分的迁移转化受含水系统中活化和阻滞作用的共同控制。当含水系统中某一组分的活化作用大于阻滞作用时，该组分在地下水富集；当活化作用小于阻滞作用时，该组分在地下水浓度降低。如在发生黄铁矿氧化的含水系统中，黄铁矿中的砷由于黄铁矿氧化溶解而被释放（活化），但若铁氧化后形成羟基氧化铁（FeOOH）的话，释放的砷被吸附到FeOOH上（阻滞），在这种情况下活化和阻滞共同决定地下水中砷浓度的大小。

在活化与阻滞作用中，不同水文地球化学过程的反应动力学存在差异，对活化与阻滞作用起决定意义的水文地球化学过程与地下水动力条件有关。例如，在土柱实验中，Mn²⁺主要以吸附和沉淀的方式滞留在土柱中，其中以MnCO₃沉淀的Mn²⁺占20%。但由于MnCO₃沉淀的速率比Mn²⁺的吸附慢3个数量级，因此水的流速决定了MnCO₃沉淀对Mn阻滞的贡献。