细胞是生物体和生命活动的基本单位，细胞分析对于细胞结构和功能的研究、生命活动规律和本质的探索、疾病的诊断与治疗、药物的筛选与设计等都具有重要的意义。近代以来，结合不同种类的分析原理，构建了许多不同的分析方法。在诸多种类的细胞分析中，以单细胞分析尤为热门。单个细胞研究，可以获得反映细胞生理状态和过程的更准确全面的信息，使人们能更好地了解细胞群体中某些特殊的细胞功能，更深入地认识细胞个体差异、细胞间相互作用等深层次的信息。1988年，A.G.尤因^[注]等首次采用毛细管电泳分析单细胞。此后，由于毛细管电泳柱的内径与细胞大小相当，适于单细胞分析，因而获得蓬勃发展，已广泛应用于蛋白质分析、神经科学、肿瘤学等领域。

细胞分析，包括单细胞分析，涉及的主要分析手段有：①显微吸收/荧光光度法。显微分光光度计能在不破坏细胞结构特点的情况下，实现细胞内物质的原位定量测量。而显微荧光光度术主要用来测量固定的细胞或组织内荧光的反应产物，可基于荧光标记物实现对细胞内组分的动态研究等。②流式细胞仪。流式细胞仪的工作原理是将待测标本制成细胞悬液，在鞘液的约束下，通过喷嘴，使其形成单个细胞流。当激发光照射到单个细胞上时，就可产生相应的荧光信号和散射信号，经计算机处理即可得到所需的图像和数据。流式细胞分析技术已经成为细胞生物学、肿瘤学、免疫学等基础和临床医学领域中的有效工具。③电化学方法及电泳技术。在电化学方面，由于微电极的体积很小，能适应动物体内复杂的生理环境，且响应时间快、传质速率较高，其探头可制作到微米级甚至纳米级，成为活体分析的重要工具。毛细管电泳应用于单细胞分析，早期主要以蜗牛的巨大神经元细胞作为分析对象，分析物为神经递质和氨基酸。该技术正在向哺乳动物和人的单细胞分析过渡，分析物的范围也在逐步扩大。

细胞分析的方法学已从毛细管电泳发展到微流控芯片，显微镜图像分析，质谱分析等，结合各种新颖的荧光探针、纳米量子点及纳米技术的应用、细胞外活体分析，使得细胞分析，特别是单细胞分析，呈现出更广阔的发展前景。