由于多来分类学的变化，植物细菌病害的病原已由原来的5个属—假单胞菌属（Pseudomonas）、黄单胞菌属（Xanthomonas）、欧文氏菌属（Erwinia）、土壤杆菌属（Agrobacterium）、棒形杆菌属（Clavibacter），增加至30多个属。

革兰氏阴性植物病原细菌中的欧文氏菌属被分成了4个属：以梨火疫病为代表的解淀粉欧文氏菌群仍保留在欧文氏菌属中，产生果胶酶的软腐菌群被并入果胶杆菌属（Pectobacterium），草生菌群被并入泛菌属（Pantoea），菊欧文氏菌（Erwinia chrysanthemi）被移入了迪基氏菌属（Dickeya）。

假单胞杆菌属被分成雷尔氏菌属（Ralstonia）、伯克氏菌属（Burkholderia）和噬酸菌属（Acidovorax）。木质部小菌属（Xylella）是1987年新建立的属，该属细菌对营养要求十分苛刻，寄主范围广，主要侵染木质部。韧皮部杆菌属（Liberobacter）是新建立的候选属（Candidatus），是一类在植物韧皮部寄生的细菌，以柑橘黄龙病病原细菌（CandidatusLiberobacter asiaticum）为代表。迪基氏菌属（Dickeya）是从最早的菊欧文氏菌中分离出来的新属，现增至8个种。其中包括达旦提迪基氏菌（D.dadantii，甘薯茎腐病菌）、香石竹迪基氏菌（D.dianthicola）、玉米迪基氏菌（D.zeae，水稻细菌性基腐病菌）、香蕉迪基氏菌（D.paradisiaca）、菊迪基氏菌（D.chrysanthemi）、水生迪基氏菌（D.aquatic）、茄迪基氏菌（D.solani，马铃薯黑胫病菌）和方中达迪基氏菌（D.fangzhongda，梨锈水病菌)。

2014年萨夫尼等提出将茄科雷尔氏菌（R.solanacearum）复合种划分为3个种: 茄科雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）、蒲桃雷尔氏菌（Ralstonia syzygii）在种内又划分成3个亚种（R. syzygiisubsp. syzygii、R. syzygiisubsp. indonesiensis和R. syzygiisubsp. celebesensis）和假茄科雷尔氏菌（Ralstonia pseudosolanacearum）。

革兰氏阳性植物病原细菌除了最早的棒形杆菌属（Clavibacter）以外，新增了节杆菌属（Arthrobacter 美国冬青叶疫病A.ilicis）、短小杆菌属（Curtobacterium，菜豆萎蔫病C.flaccumfaciens）、红球菌属（Rhodococcus，香豌豆带化病R.fascians）、芽孢杆菌属（Bacillus，小麦白叶条斑病B.megaterium）、拉塞氏杆菌属（Rathayibacter，鸭茅蜜穗病R.rathayi）、链丝菌属（Streptomyces，马铃薯疮痂病S.scabies）。

革兰氏阴性植物病原细菌的主要属有假单胞菌属（Pseudomonas）、黄单胞菌属（Xanthomonas）、土壤杆菌属（Agrobacterium）、欧文氏菌属（Erwinia）、泛菌属（Pantoea）、果胶杆菌属（Pectobacterium）、伯克氏菌属（Burkholderia）、雷尔氏菌属（Ralstonia）、噬酸菌属（Acidovorax）、木质部小菌属（Xylella）、韧皮部杆菌属（Liberobacter）、肠杆菌属（Enterobacter）、根杆菌属（Rhizobacter）、嗜木质菌属（Xylophilus）、迪基氏菌属（Dickeya）等。

革兰氏阳性植物病原细菌的主要属有棒形杆菌属（Clavibacter）、节杆菌属（Arthrobacter）、短小杆菌属（Curtobacterium）、红球菌属（Rhodococcus）、芽孢杆菌属（Bacillus）、拉塞氏杆菌属（Rathayibacter）、链丝菌属（Streptomyces）等。

有些植物细菌病原在种以下还存在亚种（subspecies, 简称subsp.）、致病变种（pathovar, 简称pv.）和生化变种（biovar, 简称bv.）。

主要分成两类，第一类为非专性寄生菌，既能寄生植物，也能在培养基上生长。寄生能力强的病原物主要为害植物健全的绿色部分，大多可以在活的植物组织内或者未分解的植物残体中生存，而在土壤或水中会很快死去。例如水稻白叶枯病细菌和棉花角斑病细菌不易在土壤中越冬，而蔬菜软腐病细菌则能在土壤中越冬。寄生能力弱的病原物则主要为害植物的贮藏器官及抵抗力弱的部位，虽然在植物体外可以长期生存，但不能大量繁殖，很快可能丧失致病性而保持生活力。如青枯菌和根癌土壤杆菌等。第二类为专性寄生菌，不能进行人工培养，或对培养条件要求十分苛刻。这类细菌有木质部难养菌、柑橘黄龙病菌等。植物病原细菌都有一定的寄主范围，有的种类寄主广泛，有的种类寄主较狭窄。

植物病原细菌多为非专性寄生，侵入寄主细胞后通常先使细胞或组织致死，然后再从坏死的组织中吸取养分。多数细菌病害有菌脓溢出。显微观察时维管束或薄壁组织病部常出现喷菌现象，是区分细菌病害和真菌、病毒病害最简便的手段之一。细菌病害导致的症状主要有腐烂、坏死、萎蔫、畸形和变色5大类。

由软腐细菌侵染植物的根、茎、块根、块茎、果实、穗等肥厚多汁器官，导致细胞解离、组织崩溃腐烂，往往有臭味，如白菜软腐病。

属于细菌病害最常见的一类，主要在叶片、果实和茎秆上出现各种不同的斑点，如水稻白叶枯病叶片枯死斑、柑橘溃疡病果实上的病斑。发生在枝条、花柄或果实上的坏死斑，常扩大成为溃疡或出现疮痂症状，更严重的则导致枝枯、顶枯等症状，在溃疡斑上也常有菌脓泌出，如梨火疫病。

因细菌侵染寄主的维管束系统导致水分运输受阻而引起，如植物青枯病。

大多发生在木本植物的根冠或茎基部及枝条上，由土壤杆菌侵染所致，如苹果、桃、葡萄根癌病和桃发根病等。由小麦粒瘿线虫和蜜穗菌复合侵染所引起的蜜穗病，表现为茎节弯曲，颖壳开张，穗部充满黄白色黏稠状菌脓，也属于畸形类型。

植物细菌病害表现为褪色和变色的症状较少。感染柑橘黄龙病通常表现为新梢黄化、叶片斑黄的症状。  

一般通过寄主的伤口或自然孔口侵入，如大豆斑疹病菌从气孔侵入，水稻白叶枯和甘蓝黑腐病菌则从水孔侵入，柑橘溃疡病菌从皮孔侵入，梨火疫病菌从蜜腺侵入等。各种自然因素如风雨、冰雹、冻害、昆虫等和人为因素如耕作、嫁接、施肥、收获、运输等造成的伤口都是细菌侵入的重要途径。部分细菌通过昆虫介体传播。

多数植物细菌病害都能发生再侵染。果树和木本植物受侵后，病原可在树干、枝条和芽鳞内越冬，成为下一年的再侵染源。

植物病原细菌的侵染来源主要有：①种子和无性繁殖材料。许多植物病原细菌可以在种子及块根、块茎、鳞茎等无性繁殖器官中越冬或越夏，成为最重要的初侵染源，如西甜瓜果斑病、马铃薯环腐病和甘薯茎腐病等。②土壤和病残体。青枯菌和冠瘿菌可以在土壤中长期存活，处于休眠状态。一旦接触到寄主植物的根部就可恢复致病力。许多植物病原细菌可以在病残体中长期存活，形成重要的侵染来源。③雨水和灌溉水传播。植物表面或菌脓中的细菌，可经过雨水和水滴实现飞溅传播。土壤和病残体中的病原物可通过灌溉水和雨水传播。④昆虫介体。玉米细菌性萎蔫病菌可在玉米叶甲体内越冬，柑橘黄龙病病原传播的介体为亚洲橘木虱，蜜蜂可作为梨火疫病病原的传播介体。

①收集抗源材料，培育抗病品种。②加强种子和植物检疫、建立无病留种田、进行药剂拌种和种苗消毒，注意田间卫生以减少初侵染菌源。③采取轮作、高垄种植等防病栽培措施，避免大水漫灌。出现小的发病中心时，及时拔除病株，集中无害化处理。④防治介体昆虫，阻断通过昆虫传播病害的侵染来源。⑤针对顽固的土传病害，可使用氯化苦、棉隆等化学土壤熏蒸剂进行土壤处理。有机铜制剂、无机铜制剂（噻菌铜、波尔多液、乙酸铜等）、抗生素类（农用硫酸链霉素、中生菌素、乙蒜素、春雷霉素等）及噻唑类等杀菌剂对原核生物病害具有较好的防治效果。⑥生物防治。多黏类芽孢杆菌、荧光假单胞杆菌、枯草芽孢杆菌及芽孢杆菌等生物农药一般对环境安全，对土壤有改良作用。