主要包括内生殖器官和外生殖器官两部分。

成年未孕母畜的卵巢在没有较大卵泡和黄体时，其形态、体积和位置变化较小。随着成年后分娩次数的增多，其卵巢形态、体积和位置发生较大的变化。牛卵巢的形态为扁椭圆形，附着在卵巢系膜上，其附着缘上有卵巢门，血管和神经即由此出入。羊卵巢比牛的圆而小，在初情期以后，卵巢形状略像蚕豆。猪卵巢的形态及大小因年龄不同而有很大的变化，初生仔猪的卵巢类似肾脏，表面光滑；接近初情期时，出现很多突出于表面的小卵泡和黄体，似桑葚；初情期开始后，卵泡上有大小不等的卵泡、红体或黄体突出于卵巢的表面，近似一串葡萄。牛、羊、猪的卵巢组织分为皮质和髓质部，两者的基质都是结缔组织。皮质内含有卵泡、卵巢的前身和续产物（红体、黄体和白体）。髓质部的结缔组织含有很多成纤维细胞、胶原纤维、网状纤维、血管、淋巴管、神经和平滑肌纤维。在初情期以前，卵巢的皮质内含有很多原始卵泡。卵巢有两个功能：①卵泡发育和排卵；②分泌雌激素和孕酮。

输卵管是进入子宫的必经通道，形状弯曲，前1/3段较粗，称为壶腹，是精卵受精部位；其余较细，称为峡部；靠近卵巢端扩大呈漏斗部，漏斗的边缘形成很多皱襞，称为伞，伞的一处附着于卵巢的上端（马的附着于排卵窝），漏斗的中心有输卵管腹腔口，与腹腔相通，主要接纳卵巢排出的成熟卵子。输卵管的管壁从外向内由浆膜、肌层和黏膜构成。输卵管的功能为：①接纳并运送卵子；②精子获能、卵子受精及卵裂的场所；③分泌功能。

母畜的子宫分为子宫角、子宫体和子宫颈3个部分。按照子宫的形态又可以分为两类：对分子宫和对角子宫。从子宫前端到子宫基部为子宫体。在青年及产胎次数较少的母牛，子宫角弯曲如绵羊角，位于骨盆腔内。经多次产胎的子宫不能完全恢复原来的形状和大小，常垂入腹腔。子宫黏膜有突出于表面的半圆形子宫阜，子宫阜上没有子宫腺，其深处含有丰富的血管。妊娠时子宫阜即发育成母体胎盘。羊的子宫形态与牛相似，只是体积较小。绵羊的子宫黏膜有时有黑斑，子宫阜中央有一呈圆盘状的浅凹。马的子宫角为扁圆桶状，前端钝，中间部稍下垂呈弧形；子宫体较其他家畜的发达，呈扁圆桶状。猪的子宫角形成很多弯曲，很似小肠；但管壁较厚，两子宫角基部之间的纵隔很不明显。子宫的组织结构从内向外由黏膜、肌层和浆膜组成。黏膜由上皮和固有膜构成。肌层外层薄，为纵行肌纤维；内层厚，为螺旋形的环状肌纤维。子宫浆膜与子宫阔韧带的浆膜相连续。子宫的功能包括：①运送精子和胎儿娩出；②精子获能和胎儿发育的场所；③对卵巢的机能产生影响；④子宫颈是子宫的门户；⑤对精子的选择性。

为母畜的交配器官，又是胎儿娩出的通道。其背侧为直肠，腹侧为膀胱和尿道。阴道腔为扁平的缝隙，前端有子宫颈阴道部突入其中。子宫颈阴道部周围的阴道腔称阴道穹窿。后端和尿生殖前庭之间以尿道外口、阴瓣为界。未曾交配的幼畜阴瓣明显。阴道在生殖过程中具有很多功能：既是交配器官，也是阴道射精型动物的精子储存库，精子在此处聚集和保存，并不断向子宫输送精子；阴道的微生物环境能保护生殖道不遭受微生物侵害；阴道通过收缩、扩张、复原、分泌和吸收等功能，排出生殖道内分泌物。

尿生殖前庭为从阴瓣到阴门裂的部分，前高后低，稍微倾斜。在前庭两侧的黏膜下层有前庭大腺，分为支管状腺，发情时腺体分泌增强。阴唇分左右两片构成阴门，其上下端联合形成阴门的上下角。两阴唇间的开口为阴门裂。阴唇的外面是皮肤，内为黏膜，二者之间有阴门括约肌及大量结缔组织。阴蒂由两个勃起组织构成，相当于公畜的阴茎，可分为阴蒂脚、体和头3个部分。阴蒂脚附着在坐骨弓的中线两旁。阴蒂头相当于公畜的龟头，富含感觉神经末梢，位于阴唇下角的阴蒂凹陷内。

内生殖器官的系膜称子宫阔韧带，由卵巢系膜、输卵管系膜和子宫阔韧带3部分组成。分布到内生殖器官的动脉，每侧有3条：卵巢动脉、子宫动脉和尿生殖动脉子宫外支。外生殖器官的主要动脉是阴部内动脉。