开放存取期刊主要采取的是在线出版形式。根据不同标准，开放存取期刊常见的划分方式有：①根据期刊的创办方式划分为原生型开放存取期刊和转化型开放存取期刊。前者指采用开放存取期刊出版模式新创办的一种期刊；后者指由传统的学术期刊转化而成的开放存取期刊。②根据期刊的访问方式和访问权限划分为完全开放存取期刊和部分开放存取期刊。前者指出版之后即可免费获取的期刊，如美国科学公共图书馆（PLoS）和生物医学期刊出版中心（BMC）出版的系列期刊；后者又称“复合开放存取期刊”，指对期刊的部分内容开放存取，如施普林格（Springer）的“Open Choice”，由作者自由选择论文是否开放，但需作者支付一定的费用。③按照实行开放存取的时间划分为即时开放存取期刊和延时开放存取期刊。前者指期刊出版的同时实施开放存取行为，即出版与开放存取是同步的；后者指期刊出版一定时间后实行开放存取模式的期刊，如《中国图书馆学报》。

和传统期刊一样，大部分开放存取期刊都有自己的质量控制系统和运作方式。开放存取期刊质量控制的主要方法有同行评议、引文分析、网络计量和综合评价法。其中，同行评议是国际上惯用的一种质量控制方法，一般由两位或两位以上资深专家进行评审，专家意见不一致时再请其他专家重新评审。具体评议形式主要有盲法评审和公开评审，盲法评审又分单盲评审和双盲评审。在运用传统同行评议方式的基础上，开放存取期刊出版机构还基于开放存取的特征创造了一些新的同行评议形式，如互动同行评议等。但由于作者付费导致作者主动权增加、评审方法的透明度较低等多重因素的综合作用，开放存取期刊的质量时常遭人诟病。

相比传统学术期刊，开放存取期刊的优势主要有以下几点：①知识传播范围更广。通过网络获得更高的引文量和下载量，提升引用影响，从而使科研成果获得更大的影响和充分的利用。②读者免费获取。它使用户能更方便地获取信息，及时获取最新的科研进展和成果，促进科学传播。③有助于打破出版商对学术出版的垄断, 在一定程度上可以减少图书馆的开支。相比传统学术期刊，开放存取期刊是基于学术自由、共享的理念，无偿提供给人们使用的学术期刊资源。此外，开放存取期刊在出版模式、期刊显示度、传播效果、影响因子、引用优势等方面甚至可能比传统学术期刊有更大发展潜力。