加拿大没有针对转基因生物安全专门立法，所以对转基因生物安全的法律法规，体现于其现有法律制度之中。加拿大的转基因生物安全管理体制采取多个机构联合管理的模式。食品监督局依据《消费者包装和标签法》《饲料法》《化肥法》《食品和药品法》《动物卫生药品法规》《种子法》《植物保护法》等法律和《饲料法规》《化肥法规》《动物卫生法规》《食品和药品法规》等法规，负责生物技术来源的植物和种子（包括拥有新性状的植物和种子）、动物、动物疫苗和生物制剂、化肥、牲畜饲料的管理。环境部依据《加拿大环境保护法》等法律和《新物质通知法规》等法规，对《加拿大环境保护法》规定的生物技术产品（如用于生物降解、废物处置、浸矿或提高原油采收率的微生物）进行管理。《新物质通知法规》适用于不受其他联邦法律管制的产品。卫生部依据《食品和药品法》《加拿大环境保护法》《有害生物防治产品法》等法律和《化妆品法规》《食品和药品法规》《新型食品法规》《医疗器械法规》《新物质通知法规》《有害生物防治产品法规》等法规，开展源于生物技术的食品、药品、化妆品、医疗器械、有害生物防治产品的管理。渔业及海洋部依据《渔业法》和《新物质通知法规》对转基因水生生物的潜在环境释放进行管理。