主校区位于马里兰州巴尔的摩市。1876年，在慈善家约翰斯·霍普金斯（Johns Hopkins）遗产捐赠的基础上建立。同年2月，D.C.吉尔曼（Daniel Coit Gilman）被任命为首任校长。在吉尔曼的领导下，约翰斯·霍普金斯大学借鉴德国海德堡大学研究生院的理念，开始注重将教学与研究相结合，专注于知识扩展和研究生教育。这种理念和模式的成功，使其成为美国乃至西半球第一所研究型大学，并促使包括芝加哥大学在内的美国大学向研究型大学转型。校训为“真理必使你们得自由（Veritas vos Liberabit）”。

约翰斯·霍普金斯大学成立之初，吉尔曼就开始专注于扩展研究生教育，并支持教师从事科研。由于约翰斯·霍普金斯大学在医学和工程学方面的高深研究，使其成为全美最早设立博士项目以及主导众多学术期刊和学术协会的大学。约翰斯·霍普金斯医院和约翰斯·霍普金斯医学院分别于1889年和1893年成立。这种以研究为导向的教学模式，很快吸引如W.奥斯勒（William Osler）在内的众多医学学者前来任教。作为美国第一所开展研究生教育的医学院，也首开以同等标准招收女学生的先河。该举措为日后许多医学教育机构所仿效。1909年，约翰斯·霍普金斯大学成为首批开设成人继续教育项目的大学之一。1916年，又率先创办全美第一所公共卫生学院。20世纪50年代，M.艾森豪威尔（Milton Eisenhower）担任校长期间，约翰斯·霍普金斯大学获得高速发展。10年间，其总收入增长3倍，并进行了雄心勃勃的扩建计划。21世纪以来，约翰斯·霍普金斯大学进行了一系列包括主楼翻新、医学新校区等的相关学校建设。2007年，经过学科整合，成立了教育学院和凯瑞商学院。共有5个校区，分别是霍姆伍德校区、东巴尔的摩校区、巴尔的摩下城校区、华盛顿特区校区和马里兰劳瑞尔校区；共有10所学院（所、室），分别是艺术与科学学院、教育学院、工程学院、护理学院、公共卫生学院、药学院、皮博迪研究所、商学院、高级国际研究学院和应用物理实验室。同时，约翰斯·霍普金斯大学也是美国第一所分专业录取本科生并以研讨会方式授课的大学。

在大学管理方面，约翰斯·霍普金斯大学由18～65名具有投票权的受托人组成的董事会负责管理，其中受托人每届任期6年，最多连任2届。大学校长作为首席执行长官，负责主管大学日常管理工作。在社会服务方面，约翰斯·霍普金斯大学在第二次世界大战期间成立的应用物理实验室（APL）接受联邦政府拨款，开展关于防务方面的科研。直到20世纪80年代，一直是美国接受政府科研资助最多的研究型大学。以重视学术自由和基础研究著称，吸引了众多学者和研究人员前来从事教学和科研工作。实行包括研究生奖学金制度在内的一系列举措，促进研究生专注科研工作。

约翰斯·霍普金斯大学图书馆系统包括各校区总共10个图书馆分馆，馆藏图书超过360万册。主要图书馆有弥尔顿·艾森豪威尔图书馆（Milton Eisenhower Library）、乔治·皮博迪图书馆（George Peabody Library）等。此外，成立于1878年的约翰斯·霍普金斯大学出版社，是全美最古老的大学出版社之一。

截至2018年，约有20 000名研究生（包括全日制和非全日制）、5000余名本科生，2700名教职工，包括全职工作人员、兼职和临时人员。

约翰斯·霍普金斯大学