由单一原初亲体，即源株（ortet），在自然条件下，通过自发的无性过程或营养过程所产生的所有有机体，即分株（ramet，如植物）、游动孢子（zooid，如被囊动物tunicate、苔藓动物bryozoan）、水螅体（polyp，如刺胞动物cnidarian），集合成为一个克隆。这些新生个体相互之间及其与亲体之间，遗传上通常都是相同的。以匍匐茎型克隆植物草莓（Fragaria）为例，其由种子萌发而来的实生苗（即源株）长到一定阶段就长出地上匍匐茎（克隆器官），匍匐茎不断伸长并分枝，长此以往，就形成克隆网络。这些匍匐茎上可长出不定根和枝叶，形成新的个体（即分株）。这些分株和源株集合成一个草莓克隆。一些海洋无脊椎动物（如海葵）和部分脊椎动物（如某些种类的鱼、两栖动物、爬行动物和哺乳动物）也能无性繁殖形成克隆。另一个例子是水螅，在生活条件相对较好时，水螅可通过出芽进行无性繁殖，源株在发育过程中会长出7～18个新个体（水螅体），最终通过无性繁殖产生更多的后代。