外源污染分为点源污染和面源污染。点源污染是指污水通过固定排放点进入水体而引起的污染，包括工业废水和城镇生活污水引起的污染等。面源污染是相对点源污染而论的，又称非点源污染，是指污染物通过地表径流、地下水渗透、大气沉降等途径进入水体形成的污染，这些污染难以追溯到具体的排放点。点源污染主要通过管网收集污水后在污水处理厂进行集中处理。面源污染治理主要包括污染物源头控制与输移过程控制。如农业面源营养盐污染控制，主要包括化肥用量控制、农田径流中营养盐滞留与去除、生态缓冲带拦截等。不同的土地利用类型所产生的面源营养盐污染强度也有差异，通过调整流域内土地利用类型也可削减进入湖泊的面源营养盐负荷。