1851～1854年在巴黎出版，共4卷。原始语种为法语。如果说《实证哲学教程》强调的是自然科学的实证精神支配一切，倡导唯科学主义，那么《实证政治体系》转而强调以爱与同情心为核心的感情支配一切，倡导唯感情主义，致力于建立没有神但又把“人类”神化的宗教。在这部著作中，孔德将实证主义演变为“彻底的实证主义”，强调感情持续占主导地位，而心智注定不是实施统治的，它不是作为感情的奴隶而是仆从来为感情服务。孔德还指出，实证政治的两个核心信条是，没有政府就没有社会，社会的恰当运行要求精神权力独立于世俗权力。政府是必要的，它的行为应用于人类社会的自发秩序，制止混乱，促进社会凝聚趋势。孔德断言，正是精神统治着世界，精神权力本质上是一种调节力量，它预设了世俗权力的存在。孔德还创立了人类教。它没有上帝或超自然的存在，而是以人性为崇拜对象。他还制定了一套教阶制度和宗教仪式，编制日历，设立教堂。此外，孔德还讨论了道德原则，提出利他主义概念，并试图使道德成为一门科学。

孔德的实证政治学被后世看作是反动的和极权主义的，而人类教也未产生多大的影响，但以道德原则为基础建立道德科学的设想深深影响了涂尔干和L.列维-布留尔等社会学家。