微生物类群比较庞杂，大致可分为细胞型和非细胞型两类。细胞型微生物包括细菌、古生菌和真核生物等。非细胞型微生物包括病毒和类病毒。

细菌和古生菌具有相似的细胞结构。多数细菌的基本形态可分为球状、杆状与螺旋状三种。主要以二分裂方式进行繁殖，多以成对、成链或成簇的形式生长，如葡萄球菌。一般直径通常在0.5～1微米。已知个体最大的细菌为舒尔茨（H.N.Schulz，德国）等1999年发现的一种硫黄细菌，大小一般在0.1～0.3毫米，一些可达0.75毫米。古生菌一般生活在极端生境中，如高盐、高温、高酸环境中。例如从太平洋海底“黑烟囱”火山口附件分离的“121株”，能在121℃的条件下生长繁殖。细菌一方面是许多疾病的病原体，包括肺结核、淋病、炭疽病、梅毒、鼠疫、砂眼等疾病均由细菌引发。同时，人类也利用细菌，进行例如乳酪及酸奶和酒酿的制作、部分抗生素的制造、废水的处理等。在生物科技领域中，细菌也有广泛的运用。

真菌是生物界中很大的一个类群。世界上已被描述的真菌约有1万属12万余种。人们通常将真菌门，分为壶菌门、接合菌门、子囊菌门、担子菌门和半知菌类。真菌的形态多样，一般分为单细胞和多细胞，酵母菌属于单细胞，而霉菌和蕈菌属于多细胞。大型真菌是指能形成肉质或胶质的子实体或菌核，大多数属于担子菌亚门，少数属于子囊菌亚门。常见的大型真菌有香菇、草菇、金针菇、双孢蘑菇、平菇、木耳、银耳、竹荪、羊肚菌等。真菌会引起许多动植物疾病，如白粉病及腐烂病等。同时，真菌在酿造、食品、医药工业等方面占有重要地位。

是指除苔藓植物和微管属植物以外，基本上有叶绿素，可进行光合作用并伴随放出氧气的一大类真核生物，大多个体只能通过显微镜才能观察到。藻类在自然界，特别是各种水体中广泛存在，是影响水质的重要原因之一。

指一类缺少真正细胞壁，细胞通常无色，具有运动能力并进行吞噬营养的单细胞真核生物。个体微小，大多需要显微镜才能看见。原生动物在自然界，特别是海水、淡水中大量存在，它们也与各种动植物在不同组织水平上形成共生体，有些对宿主无害，有些对宿主有利，有些则有害，也有一些原生动物可以引起人类疾病。

指一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的非细胞生物。病毒主要由蛋白质衣壳及核酸组成。一般直径在100纳米左右，最大的病毒直径为200纳米的牛痘病毒，最小的病毒是直径为28纳米的脊髓灰质炎病毒。病毒的生命活动中一个显著的特点为寄生性。病毒只能寄生在某种特定的活细胞内才能生活，并利用宿主细胞内的环境及原料快速复制增殖。病毒在非寄生状态时呈结晶状，不能进行独立的代谢活动。