主要植物病原真菌类群包括根肿菌门、接合菌门、子囊菌门、担子菌门以及一些无性型菌物。许多真菌病害由于病菌及寄主的不同而有明显的地理分布，如煤病、炭疽病、疫病（在亚热带和热带种类多，危害重）、黑粉病、壳针孢属等引起的叶斑病、核盘菌属引起的菌核病（主要发生在温带）等。有些真菌在北方寄生性弱、不致病，但在热带、亚热带则可引起严重病害。

常见的真菌病害症状有霜霉、白粉、白锈、黑粉、锈粉、烟霉、黑痣、霉状物、蘑菇状物、棉絮状物、颗粒状物、绳索状物、黏质粒和小黑点等。大的病征可用肉眼直接观察到。病征的出现与寄主的品种、器官、部位、生育时期、外界环境有密切关系。如不少叶斑病菌一般在寄主生育后期才产生病征，甚至在落叶上才形成小黑点。许多真菌病害在环境条件不适宜时完全不表现病征。真菌病害的症状与病原真菌的分类有密切关系。

真菌病害的侵染循环类型最多，许多病菌可形成特殊的组织或孢子越冬。在温带，土壤、带病种子、病残组织和果树林木的病枝常是越冬场所；在热带和亚热带，不少病菌不越冬而越夏。冬季生长的寄主在侵染循环中往往起重要作用，有些病菌的分生孢子可越冬，有的病菌终年有危害性。大多数病菌的有性孢子在侵染循环中起初侵染作用，其无性孢子起不断再侵染的作用。由于真菌性病害的气流和水流传播较突出，一般多采用化学药剂进行保护性防治，或通过改进栽培管理措施加以防治。