量子点元胞自动机的计算方法是建立在量子点元胞基础上，通过元胞之间的库仑力来改变元胞的状态进行编码。这种方法的特点是，元胞的态通过改变外加场而改变，过程中没有电流，因此没有能量传输。例如，通过正方形排列的4个量子点构造出一个元胞，按照顺时针方向依次标记为1、2、3、4，在其中束缚住两个电子，电子由于斥力作用将会有两种自然稳态，也就是电子在1、3或2、4的位置上，将这样两个态编码为“0”和“1”即为一个计算比特单元。根据这种元胞结构的真值表以及改变排列方式，可以实现基本电路器件和逻辑门功能。

量子点元胞自动机的实现方案有半导体量子点、金属量子点和分子电子等。以半导体量子点为例，在砷化镓和砷化镓铝的二维电子气（two-dimensional electron gas; 2DEG）层上，通过调整外加电极结构和施加电压，就可以限制住4个量子点区域并调节电压控制两个额外电子，然后通过进一步调节电极电压影响量子点内的电子分布，这样就实现了元胞自动机的功能。