成立于1946年。1984年起隶属于法国国家教育研究与技术部和法国农业与渔业部监管。经费主要来自国家政府。法国国家农业科学院集中了农学多学科的优势，组织和开展所有与农业畜牧业林业及相关领域工业方面的研究和开发，协助国家部门制定有关的国家政策出版和传播其科研成果，参与科技信息的开发及科技知识的传播，推广法语的使用，开展研究培训和进修培训促进科研成果的推广应用，开展有关学术领域的科学评估。有6个学科研究方向：环境森林与农业、植物和植物产品、牲畜和畜牧产品、人类营养与食品卫生、社会经济与决策和农业发展与展望。主要通过科研课题组织和资助科研活动保持其科研工作的最高水平，由科研理事会和专家科学委员会定期对进行的研究工作进行评议和展望，以保证研究的质量和水平。

法国国家农业科学院设有17个研究学部，植物生物学、生物统计与人工智能、农村经济与社会学、畜牧与动物营养、环境与农艺学、森林与天然环境、动物遗传、植物遗传学与改良、水生物学与野生物学、微生物学、营养食品与食品安全、动物生理学、动物健康、植物健康与环境、农业耕地系统及其开发、动物产品的加工、植物产品的加工17个科学部。在全国各地区建有250个实验室，48个实验单位，13个科研部门，17个研究中心，其中56个研究单位设在法国，本土外还有87个农业实验站，以及11个农业科技服务部。法国国家农业科学院还重视组织法国科学家对外进行国际合作交流，专门设立了国际关系部负责国际合作交流计划的实施。另外，法国国家农业科学院设有出版社和巴黎大区的两个文献资料中心及21个地区资料中心，也是世界第二大农业科学出版商，在法国内有21个农艺信息点。