水溶性共轭聚合物兼具共轭聚合物优异的光电性能和良好的水溶液溶解性，已应用于有机发光二极管显示、离子检测、蛋白质检测、生物成像、疾病诊断和治疗等领域。水溶性共轭聚合物按照结构可分成两类。一类是共轭聚合物主链的侧基修饰亲水性基团，亲水性基团包括离子基团和电中性的亲水性基团，常见的离子基团有磺酸根（）、羧酸根（）、磷酸根（）、铵根（）等，常见的电中性基团有短的醚氧链和糖化合物等。另一类是水溶性的聚合物链接在共轭聚合物的一端、两端或侧链，分别形成两嵌段、三嵌段或刷状共聚物，此类水溶性共轭聚合物也称两亲性的共轭共聚物。此类水溶性共轭聚合物中常见的水溶性聚合物为聚N-异丙基丙烯酰胺、聚丙烯酸、聚2-（双甲基胺）乙基甲基丙烯酸酯和聚乙二醇等。