生态工业园水系统集成是物质集成的重要部分。水系统包括给水系统、用水系统、污水处理系统、中水系统、承纳系统及管理系统。生态工业园水系统集成就是运用水质数量的多目标水资源优化配置模型，建立园区工序内部、企业及企业之间用水循环思想，提高水的循环利用率，采用先进工艺对循环水系统的排污水及其他排水进行有效处理，使工业废水资源化，实现工业废水最小化或区域废水零排放。园区层面的水系统集成主要有以下途径：①废水级联使用，即一个工业过程产生的废水，供下一个对水质要求较低的工业过程使用。②废水集中回用，对若干企业产生的废水进行集中处理后，进行回用。③废水处理设施共享，即临近企业共用一个废水处理基础设施，既可以减少企业在基础设施方面的投入，也可以提高基础设施的服务效率。