非矿异常形成的原因很多，大致可以归为4类：①由岩性变化引起的岩石地球化学异常。如基性超基性岩地区出现的铜、锌异常，黑色页岩地区出现的钼、砷、银等多元素异常。②地表天然富集作用形成的地球化学异常。如铁锰氧化物、铝土矿及有机物质富集，大量金属形成的地球化学异常。③由人类生产活动形成的地球化学异常。如老峒、废矿堆、选矿厂、冶炼厂、公路-铁路碎石、农药厂、工业废物排放处等形成的地球化学异常。④由于分析过程失控造成的误差或错误引起的地球化学异常。如碎样污染形成的钨异常（钨钢磨盘碎样引起）或多元素组合异常（矿石样品和其他低含量样品混磨引起），烘箱温度计损坏形成的汞异常，分析批次间误差形成的地球化学异常等。