根据水产养殖的不同类别，可以对水产养殖企业进行相应分类。按养殖水体盐度的高低，水产养殖企业可分为淡水养殖企业和海水养殖企业两种。按水域分，海水养殖企业包括海上养殖企业、滩涂养殖企业和其他海水养殖企业；淡水养殖企业包括池塘养殖企业、湖泊养殖企业、水库养殖企业、河沟养殖企业、稻田养成鱼企业和其他淡水养殖企业。按养殖方式，海水养殖企业包括池塘养殖企业、普通网箱养殖企业、深水网箱养殖企业、筏式养殖企业、吊笼养殖企业、底播养殖企业和工厂化养殖企业；淡水养殖企业包括围栏养殖企业、网箱养殖企业、工厂化养殖企业。

除极少数工厂化养殖以外，和农业种养殖企业一样，水产养殖企业的生产情况很大程度受自然气候和疾病的影响，特点有：①对自然资源的依赖性强。水产养殖必须有良好的水质和自然环境，对海洋和水域资源的依赖性很强。②劳动密集型特征明显。尽管中国水产养殖的自动化、工厂化已经取得较大发展，但是整个行业仍然属于劳动密集型产业，需要大量的劳动力。③产品易腐、运输困难。水产养殖企业的产品主要是渔获物，具有易腐难储的特点。④中国消费者对鲜活水产品的喜好，使得渔获物难以远距离运输。⑤行业退出成本高。水产养殖企业的生产设备和技术很难用于其他行业，特别是网箱养殖和工厂化养殖，一旦投资，很难在短期内退出。

1978年以来，随着中国居民收入水平提高，对水产品的需求日益增长，推动了中国水产养殖企业的迅速发展。到21世纪，中国水产养殖企业数量众多，但是经营规模小且比较分散。