沃土工程起源于“沃土计划”。为培肥地力，确保农业持续稳定发展，中国农业部从1995年夏季开始在全国实施以积极制造有机肥为主要内容的“沃土计划”，总体目标是每年每亩耕地有机肥投入量不少于2000千克，有机肥投入总量年递增5%，至20世纪末，全国现有耕地地力产量提高一个等级。

总体目标是提高耕地基础生产能力，建立耕地质量建设和保护的长效机制。主要任务是：①增加土壤有机质投入。②提高耕地、肥料和水的利用率。③改良土壤，改造中低产田。④防治农田污染，防止水土退化。⑤建立健全相关法律法规和技术标准体系。

沃土工程包括土壤肥力的培育、水资源的合理利用及肥料的科学使用等相关技术手段。沃土工程的实施方法主要有测土配方施肥、保护性耕作等。1988年，国务院发布了《关于重视和加强有机肥料工作》的指示，农业部由此提出了在全国实施以增施有机肥为核心的“沃土计划”。1991年，国家计划委员会、农业部、建设部联合下发了《关于进一步加强有机肥料工作的通知》。2001年，中国将有机肥、微生物肥料列为允许使用的主要肥料品种。2004～2009年，中共中央一号文件均直接或间接引导鼓励农民多施有机肥，增加土壤有机质。2008年6月1日起，中国有机肥产品免征增值税。

有效地改善了中国地区农业生产环境和生态环境，为农业增效、农民增收创造了条件，同时健全了区域农业服务功能和服务体系。为保障国家粮食安全、生态安全和农业可持续发展提供了强有力的科技支撑。