生于鹿儿岛县伊佐市。1987年，20岁的他投稿到《周刊少年JUMP》时被编辑发现，编辑将他介绍给漫画家北条司，成为北条司的助理。1988年，以本名成合雄彦投稿《紫色的枫》，该作品入选第35届手冢奖。此后，又发表多部连载漫画，并为渡边和彦的《变色龙》作画。1990年，开始在《周刊少年JUMP》上连载《灌篮高手》，在日本掀起篮球热潮。1995年，《灌篮高手》荣获第40届小学馆漫画赏。1993～1996年，由东映动画制作的电视动画《灌篮高手》在朝日电视台播出，共101集。2013年，为纪念动画《灌篮高手》诞生20周年，《灌篮高手》的重制高清版动画开始播出。1996年，井上雄彦用电脑创作的全彩色、以篮球为题材的漫画《零秒出手》发表。2005年，同名动画在WOWOW电视台播出。2007年，日本电视台播放了同名动画的续集。两季的动画原作、监修都是井上雄彦。1998年9月起，井上雄彦在周刊《Morning》上开始连载改编自吉川英治的历史小说《宫本武藏》的漫画《浪客行》。《浪客行》被称为水与墨、剑与禅的史诗，荣获第6届手冢治虫文化赏漫画大赏、第4届日本文化厅媒体艺术祭漫画部门大赏等奖。2000年，在漫画杂志《周刊少年JUMP》上发表励志漫画《命运强手》。2001年，《命运强手》获日本第5届文化厅媒体艺术祭优秀奖。井上雄彦的画工细腻飘逸，分镜构图充满张力和意境；在漫画技法上，由钢笔线描的方式向用毛笔创作水墨漫画风格的探索，独树一帜。