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系统进化树
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phylogenetic tree
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phylogenetic tree
酶半理性设计
研究物种进化和系统分类的方法。又称系统演化树(evolutionary tree)。
计算机辅助设计
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computer-aided design
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computer-aided design
酶半理性设计
通过计算机引入一种或几种算法对大量氨基酸序列的结构信息进行计算和排序,进而更加精准地预测关键残基及其相关突变体活性的酶理性设计的方法。与传统的理性设计相比具有高效、经济的特点。
分子动力学模拟
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molecular dynamic simulation; MD
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molecular dynamic simulation; MD
酶半理性设计
主要依靠牛顿力学原理模拟分子体系的运动,从分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本,计算体系的构型积分,并以构型积分结果为基础进一步计算体系的热力学能量和其他宏观性质的技术。
组合活性中心饱和试验
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combinatorial active-site saturation test; CAST
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combinatorial active-site saturation test; CAST
酶半理性设计
基因随机诱变的方法。
酶半理性设计
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semi-rational design
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semi-rational design
酶半理性设计
在非理性设计(定向进化)的基础上加入理性设计的元素,根据结构—功能关系,选择少数特定的氨基酸残基构建简洁的突变库,通过筛选获得阳性突变体的酶改造方法。相对于非理性设计大大降低了库容量,提高了效率。
盒式诱变
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cassette mutagenesis
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cassette mutagenesis
饱和突变
利用一段人工合成的具有突变序列的寡核苷酸片段,即所谓的寡核苷酸盒,取代野生型基因中的相应序列的方法。又称片段取代法。
全质粒扩增诱变
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whole plasmid amplification mutagenesis
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whole plasmid amplification mutagenesis
饱和突变
利用在聚合酶链反应(PCR)引物上设计引入突变位点,对整个质粒进行扩增的方法。
重叠延伸聚合酶链反应
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over-lap PCR
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over-lap PCR
饱和突变
将若干首尾带有互补序列的DNA片段进行拼接,形成一个长片段DNA的特殊聚合酶链反应(PCR)。
饱和突变
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saturation mutagenesis
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saturation mutagenesis
饱和突变
通过特定位点密码子的改变,使该位点可以翻译为20种氨基酸中所有可能的氨基酸的基因突变方法。
定点引物诱变
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site-primer mutagenesis
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site-primer mutagenesis
饱和突变
在引物序列上设计突变,通过聚合酶链反应(PCR)方法将突变引入目的基因的技术。
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